Lista dokumentów w programie do fakur afaktury.pl posiada bardzo bogatą funkcjonalność. W tym miejscu znajduje się podgląd wszystkich wystawionych faktur oraz innych dokumentów takich jak faktury zaliczkowe, proformy itd.
Każdą fakturę można indywidualnie wysłać, wydrukować, oznaczyć ją jako zapłaconą lub nadać jej odpowiedni status oraz dopisać uwagę.
Ukryte uwagi są notatką do dokumentu widoczną tylko w liście dokumentów. Zatem, jeżeli mamy potrzebę opisania faktury, zostawienia informacji innej osobie wówczas w polu „ukryte uwagi” wpisujemy takowy opis.
Jak samo słowo „ukryte” mówi, że wpisana informacja nie pokazuje się na dokumencie. Widoczna jest tylko w liście dokumentów. Uwagę tę można edytować lub całkowicie usunąć.
Kolumna „Uwagi” jest uwidoczniana na życzenie. Kolumnę z uwagami zaznaczyć należy w Ustawieniach kolumn. 
Po zaznaczeniu w inteligentnej liście dokumentów pojawi się dodatkowa kolumna, w której po kliknięciu „edytuj” otworzy się okienko, w którym wpisujemy notatkę.

Po wpisaniu odpowiedniej notatki zatwierdzamy przyciskiem "Zapisz".
Wóczas w liście dokumentów w kolumnie "Ukryte uwagi" uwidoczniona zostanie notatka. Notatkę tę można w każdej chwili edytować lub całkowicie usunąć klikając ponownie "edytuj".
Dodawanie Uwag możliwe jest również podczas wystawiania dokumentu.
Na dole formularza znajduje się rozwinięcie pól, w których możma wpisać dodatkowe informacje, opisy do dokumentu jak również Uwagi do dokumentu. 
Po rozwinięciu ukażą się wiersze, m.in informacje ukryte. Po zapisaniu dokumentu, "informacje ukryte" pokażą się w liście dokumentów w kolumnie "Ukryte uwagi". Ta notatka umieszczona podczas wypisywania dokumentu, również wyświetlona będzie tylko w liście dokumentów. Na dokumencie nie będzie widoczna. 
Archiwum dokumentów
Różne wzory faktury
Tłumaczenia na 31 języków
Baza kontrahentów
Multidruk faktury
Eksport / Import
Kontrola płatności
Statystyki Raporty
Kody QR
Subkonta
Zdjecia produktów
Faktury cykliczne
Faktury kosztowe
Ewidencja sprzedaży
Windykacja faktur
Faktury walutowe
Płatności online
Kp i KW
Oferta handlowa
Oddziały firm
Kody GTU
Logo na fakturze
Kody EORI
Kalendarz
Pliki JPK
Konwertowanie dokumentów
Inwentaryzacja
Statusy dokumentów
Historia wpłat
Finansowanie faktur
Wysyłka SMS
Historia zmian dokumentu
Konfiguracja e-maili
Zaciąganie danych z GUS
Numeracja dokumentów
Weryfikacja kontrahenta
Uwagi do dokumentów
API Afaktury
Zamówienia
Bezpieczeństwo
Pieczęć graficzna
Wysyłka dokumentów
Pokaż wszystkie funkcje